1.消化系统表现：腹痛、腹泻、腹部包块（以右下腹与脐周为多见，是由肠粘连、肠壁与肠系膜增厚、肠系膜淋巴结肿大、内瘘或局部脓肿形成所致）、瘘管形成、肛门直肠周围病变。

2.全身表现：

发热：由于肠道炎症活动或继发感染引起，常为间歇性低热或中等度发热，少数呈弛张热，可伴毒血症。

营养障碍：因食欲减退、慢性腹泻及慢性消耗疾病所致消瘦、贫血、低蛋白血症、维生素缺乏、缺钙、骨质疏松等症状。

急性发作期有水、电解质、酸碱平衡紊乱。

3.肠外表现：

部分患者有虹膜睫状体炎、葡萄膜炎、杵状指、关节炎、结节性红斑坏疽性脓皮病、口腔黏膜溃疡、慢性肝炎、小胆管周围炎、硬化性胆管炎等，偶见淀粉样变性或血栓栓塞性疾病。

其中克罗恩病同溃疡性结肠炎十分相似，鉴别点在于：

（1）溃疡性结肠炎主要累及直肠和降结肠，克罗恩病主要累及终末回肠和结肠；

（2）病理：克罗恩病是肉芽肿性疾病，以Th1（CD4＋T细胞的一个亚型）为主导。之所以形成肉芽肿是因为Th1细胞分泌的IFN-γ促进巨噬细胞参与形成的。溃疡性结肠炎非肉芽肿性疾病，以Th2（CD4＋T细胞的另一个亚型）为主导。